Pokémon Crystal é, assim como Pokémon Yellow foi para a Geração I, uma edição especial para a Geração II. Foi lançada a 14 de dezembro de 2000 no Japão e a 30 de julho de 2001 nos Estados Unidos.
A versão japonesa possuía suporte para um adaptador para celulares, que foi removido nas versões ocidentais. O Centro Pokémon de Goldenrod Cityfora adaptado paratal. Muitas das novidades que dependiam desta função reapareceram na Geração III, sob a forma de Record Corner e Union Room.